サブチャートもどの順番で行っても良いです。
ただ、連鎖イベントもあるので、そのあたりは注意しておくと良いでしょう。
一応シナリオ詳細は控えめに書いてます。

□グスタフとの戦闘
グスタフ師団と交戦。捕らえれば内政時に仲間に加わる。
その後、ソプニカ城でギョルが挙兵する。

□グインガルの洞窟
トランバン城とガーラン城の間にある山（町アイコン）にジュノーン師団が着くとグインガル（ドラゴニア×0）が登場し戦闘になる。
グインガルを倒せしてもこの時は仲間にならない。

□ザド強襲
グインガルイベントを終えて一定時間経つとザドが出現。
登場箇所はジュノーン師団がいる場所なので補強しておこう。
そのまま内政になると、グインガルが仲間に加わる。

□伝説の忍者ハヤテ
ボザック北にある町アイコンに部隊が待機すると、ハヤテの弟子シロウが登場する。
これを倒すと兵法の書が貰える。さらにジュノーン師団で同ポイントに待機させるとハヤテとの一騎討ちが始まる。
この戦闘終了後（勝っても負けても）、ハヤテとシロウが仲間になる。

□魔の塔のヴァンパイア、ハイム
トランバン西にある塔にジュノーンの部隊のみで行くとハイムと戦闘になる。
これを倒すとハイムが仲間になる。

□リスキーマ登場
ハイムを仲間にしてから、一定時間経つとリスキーマが登場する。
この時、ハイムを含めた師団で倒すとセーラが仲間に加わる。
ハイムを加えてない師団で倒すとハイムがトパーズ軍から離脱してしまう。

□リスキーマ、再び
リスキーマを倒してから一定時間経つと、ジュノーンを人質に取ろうとするが...。その後は戦闘になる。

□魔剣エクリクシス
ライトニアに攻め込むと、イベントが発生して、ベルターナ来訪も起きるが、
放っておくと勝手に消滅してしまう。（恐らくゴルダーク脱走イベントまでが期限？）

□アヤメとマツリ
ゲームを開始してしばらく経つと、参謀ミュリカから三日月伝説の話を聞く。
ムーンパレス南にある町アイコンにジュノーン師団が行くと
アヤメとマツリが登場。これを倒すと運命の将星録が手に入る。
しかしハーセルドにあわないと、まだ見れない。

□ハーセルド
ジーナ城北の町にジュノーン師団が行くとハーセルドが登場する。
これに勝つと将星録の封印が解け見れるようになる。